2018-10-16
阅读量:
2207
决策树画roc曲线的折点问题
使用的是pROC包,关于roc()的参数我有点疑惑,modelroc <- roc(my第一个mydata.testy是实际数据里y变量的值,res_cost是我使用C50包构建决策树之后用predict.C5.0函数得到的预测结果,这两个都是factor的vector应该是,然后直接运行的话报错:第二个参数必须是numeric或者有序的,我就用as.numeric把res_cost转换成数字最后得到的图像是一条直线没有折点,如何设置更多的折点?
tree <- rpart(HCAI ~ hospital + age + gender + admseason + low_protein + UC + UN + UCN + UCL + UNL + LOS + fever + LOSICU + surnum + preoperative + postoperative + postoperative_ant + postoperative_antD + bacterial_culture + antibiotic + antibioticD + comb_ant + comb_antD + spec_ant + spec_antD + sing_antD + doub_antD + Trip_antD + blood_exam + abblood + uri_exam + aburi + ventilatorD + ventilatorT + cvcD + cvcT + uriD + uriT + add, method = "class", data = LR_train)
tree
#ROC曲线的绘制
library(pROC)
froc <- roc(LR_trainHCAI,treey)
HCAI,treey)
froc
plot(froc, print.auc = TRUE, auc.polygon = TRUE, legacy.axes = TRUE,
grid = c(0.1, 0.2), grid.col = c("green", "red"), max.auc.polygon = TRUE,
auc.polygon.col = "skyblue", xlab = "1-specificity", ylab = "sensitivity")
ci(froc)
115.7926
4
0
关注作者
收藏
评论(0)
发表评论
暂无数据
推荐帖子
0条评论
0条评论
1条评论