2018-10-25
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关于Fisher's exact计算的问题
这两天在看一篇论文,文中用到了Fisher's exact p值的计算。作者给的原始数据是(14,8606,21,10197659),计算出的p值是2.12E-34。由于我学R没有多长时间,便试着在R 2.15.2中再次验算,居然算出结果是2.2E-16。我觉得这两个结果之间差距太大了,于是请教了一个师兄,nice的帮我解答了一下,分享给大家参考。
> fisher.test(matrix(c(14,8608,21,10197659), nrow = 2))
Fisher's Exact Test for Count Data
data: matrix(c(14, 8608, 21, 10197659), nrow = 2)
p-value < 2.2e-16
alternative hypothesis: true odds ratio is not equal to 1
95 percent confidence interval:
368.2732 1600.0000
sample estimates:
odds ratio
798.1286
> tmp <- .Last.value
> tmp$p.value
[1] 2.128486e-34
0.0000
0
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