2019-03-15
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nls在一些数据子集上失败,但在其他类似的子集上没有失败
我正在尝试按年将nls函数应用于数据,因此每年都会有一个单独的nls函数。所有年份都大致相似(指数衰减),但有些年份nls()函数失败并出现“奇异梯度”误差。
工作的数据:
good_data = data.frame(y = c(8.46,6.87,5.81,6.62,5.85,5.79,4.83,4.94,4.95,5.27,5.05,5.38,5.08,3.98),
x = c(2,6,6,7,7,8,9,10,12,13,14,15,16,17))
失败的数据:
bad_data = data.frame(y = c(8.99,5.86,5.32,5.74,5.41,5.04,4.66,4.52,4.18,4.66,5.38,5.46,5.21,5.37,4.89),
x = c(2,6,6,7,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17))
尝试过nls:
fit = nls(y ~ SSasymp(x, Asym, R0, lrc), data = good_data)
在我看来,这两组数据看起来非常相似。有什么方法可以诊断为什么一个失败而另一个失败?有什么我可以做的来解决它吗?
解决办法:如果通过首先进行样条曲线拟合来添加更多点,则会收敛:
sp <- with(bad_data, spline(x, y))
fit2sp <- nls(y ~ SSasymp(x, Asym, R0, lrc), data = sp)
fit2sp
赠送:
Nonlinear regression model
model: y ~ SSasymp(x, Asym, R0, lrc)
data: sp
Asym R0 lrc
5.0101 22.1915 -0.2958
residual sum-of-squares: 5.365
Number of iterations to convergence: 0
Achieved convergence tolerance: 1.442e-06
和绘图:
plot(y ~ x, bad_data)
points(y ~ x, sp, pch = 20)
fit2sp <- nls(y ~ SSasymp(x, Asym, R0, lrc), data = sp)
lines(fitted(fit2sp) ~ x, sp, col = "red")
53.7385
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