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R语言处理二进制文件
2017-06-18
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R语言处理二进制文件

二进制文件是包含只存储在比特和字节形式的信息的文件(0和1)。它们不是人类可读,将它的字节转换为包含许多其他非打印字符的字符和符号。尝试读取使用任何文本编辑器会显示类似 Ø 和 ð 字符的二进制文件。二进制文件必须由特定程序读取使用。例如,一个微软Word程序的二进制文件只能由Word程序来读取以人类可读形式。这表明,除人类可读文本,有更大量的字符像和页码等的格式信息,其也一起存储字母数字字符。最后一个二进制文件是连续的字节序列。 我们在一个文本文件中看到的断点是一个字符加入第一行到下一个!

有时需要由其他程序所产生的数据,也可以由R为二进制文件进行处理。R语言必需创建可以与其他程序所共享的二进制文件。

R具有两个函数 WriteBin()和 readBin()创建和读取二进制文件。

语法

writeBin(object, con) readBin(con, what, n )

以下是所使用的参数的说明:

con - 是连接对象读或写的二进制文件。

object - 是要被写入的二进制文件。

what - 是像字符,整数等代表字节模式被读取。

n - 是要从二进制文件中读取的字节数。

示例

我们考虑R内置数据 "mtcars". 首先,我们从它来创建一个CSV文件,并将其转换为二进制文件并将其保存为一个OS文件。接下来,我们将创建的这个二进制文件读取到R中

写二进制文件

我们读出的数据帧 "mtcars" 作为一个 CSV 文件,然后把它写为二进制文件到操作系统。

# Read the "mtcars" data frame as a csv file and store only the columns "cyl","am" and "gear".
write.table(mtcars, file = "mtcars.csv",row.names=FALSE, na="",col.names=TRUE, sep=",")

# Store 5 records from the csv file as a new data frame.
new.mtcars <- read.table("mtcars.csv",sep=",",header=TRUE,nrows = 5)

# Create a connection object to write the binary file using mode "wb".
write.filename = file("/web/com/binmtcars.dat", "wb")

# Write the column names of the data frame to the connection object.
writeBin(colnames(new.mtcars), write.filename)

# Write the records in each of the column to the file.
writeBin(c(new.mtcars$cyl,new.mtcars$am,new.mtcars$gear), write.filename)

# Close the file for writing so that it can be read by other program.
close(write.filename)

读二进制文件

上述存储二进制文件创建的所有数据连续字节。因此我们将通过选择的列名的适当的值,以及读取它的列值。

# Create a connection object to read the file in binary mode using "rb".
read.filename <- file("/web/com/binmtcars.dat", "rb")

# First read the column names. n=3 as we have 3 columns.
column.names <- readBin(read.filename, character(),  n = 3)

# Next read the column values. n=18 as we have 3 column names and 15 values.
read.filename <- file("/web/com/binmtcars.dat", "rb")
bindata <- readBin(read.filename, integer(),  n = 18)

# Print the data.
print(bindata)

# Read the values from 4th byte to 8th byte which represents "cyl".
cyldata = bindata[4:8]
print(cyldata)

# Read the values form 9th byte to 13th byte which represents "am".
amdata = bindata[9:13]
print(amdata)

# Read the values form 9th byte to 13th byte which represents "gear".
geardata = bindata[14:18]
print(geardata)

# Combine all the read values to a dat frame.
finaldata = cbind(cyldata, amdata, geardata)
colnames(finaldata) = column.names
print(finaldata)

当我们上面的代码执行,它会产生以下结果及图表:

 [1]    7108963 1728081249    7496037          6          6          4
 [7]          6          8          1          1          1          0
[13]          0          4          4          4          3          3

[1] 6 6 4 6 8

[1] 1 1 1 0 0

[1] 4 4 4 3 3

     cyl am gear
[1,]   6  1    4
[2,]   6  1    4
[3,]   4  1    4
[4,]   6  0    3
[5,]   8  0    3

我们可以看到,我们从二进制文件得到原始数据回来到R


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