R语言柱状图

2017-06-13

R语言柱状图 柱状图代表分时段进入范围的变量值的频率。柱状图类似于条形图表但不同的是它组织中的值为连续范围。在柱状图的每个条代表存在于该范围内的值的数量的高度。 R使用 hist() 函数创建一个柱状图。 ...

R语言做主成分分析实例

2017-06-12

R语言做主成分分析实例 在做多样本的RNA-Seq数据中经常会用到主成分分析（PCA）来分析，那么什么是PCA呢，这个可以百度一下，大概意思如下： 主成分分析法是数据挖掘中常用的一种降维算法,是Pearson在1901年 ...

R语言利器之ddply和aggregate

2017-06-11

R语言利器之ddply和aggregate ddply和aggregate是两个用来整合数据的功能强大的函数。 　　aggregate(x, ...) 　　关于aggregate()函数的使用在《R语言实战》中P105有简单描述，这里重新说一下。此函数主要有一 ...

R语言从SNPedia批量提取搜索数据

2017-06-11

R语言从SNPedia批量提取搜索数据  SNP是单核苷酸多态性，人的基因是相似的，有些位点上存在差异，这种某个位点的核苷酸差异就做单核苷酸多态性，它影响着生物的性状，影响着对某些疾病的易感性。SNPedia是 ...

R语言面向对象编程:S3和R6

2017-06-10

R语言面向对象编程:S3和R6 一、基于S3的面向对象编程 基于S3的面向对象编程是一种基于泛型函数(generic function)的实现方式。 1.S3函数的创建 S3对象组成：generic(generic FUN)+method(generic.class FUN） ...

R语言数据分析利器data.table包—数据框结构处理精讲

2017-06-10

R语言数据分析利器data.table包—数据框结构处理精讲 R语言data.table包是自带包data.frame的升级版，用于数据框格式数据的处理，最大的特点快。包括两个方面，一方面是写的快，代码简洁，只要一行命令就可以完 ...

R语言通过parallel包实现多线程运行

2017-06-10

R语言通过parallel包实现多线程运行 总的来说，R的运算速度不算快，不过类似并行运算之类的改进可以提高运算的性能。下面非常简要地介绍如何利用R语言进行并行运算         ...

R语言通过loess去除某个变量对数据的影响

2017-06-10

R语言通过loess去除某个变量对数据的影响 当我们想研究不同sample的某个变量A之间的差异时，往往会因为其它一些变量B对该变量的固有影响，而影响不同sample变量A的比较，这个时候需要对sample变量A进行标准化之 ...

R语言实现质量控制图

2017-06-09

R语言实现质量控制图 上次费了半天劲写出了Xbar-R代码之后第二天就发现了R语言中的SixSigma和qcc程序包。各种质量控制图应有尽有，画的还比我好看#手动微笑。 > library(qcc)  #加载qcc程序包 ...

使用R语言预测泰坦尼克号乘客生存率

2017-06-09

使用R语言预测泰坦尼克号乘客生存率 1912年4月10日，号称 “世界工业史上的奇迹”的豪华客轮泰坦尼克号开始了自己的处女航，从英国的南安普顿出发驶往美国纽约，4月14日晚，泰坦尼克号在北大西洋撞上冰山而倾覆 ...

利用R语言的Boruta包进行特征选择

2017-06-09

利用R语言的Boruta包进行特征选择 变量选择是模型构建的一个重要方面，每个分析人员都必须学习。毕竟，它有助于排除相关变量、偏见和不必要噪音的限制来建立预测模型。 许多分析新手认为，保持所有（或更多 ...

R语言中的回归诊断-car包

2017-06-09

R语言中的回归诊断-car包 如何判断我们的线性回归模型是正确的？ 1、回归诊断的基本方法 opar<-par(no.readOnly=TRUE) fit <- lm(weight ~ height, data = women) par(mfrow = c(2, 2)) plot(fit) par(op ...

R语言实现Xbar-R控制图

2017-06-07

R语言实现Xbar-R控制图 Xbar-R控制图在质量管理中主要用于对计量数据进行检测，以达到控制对象质量的目的。 虽然用Excel可以轻松实现控制图的操作，不过作为R软件初学者，我试着用仅有的一点R语言知识进行了 ...

R语言学习之向量—启航

2017-06-02

R语言学习之向量—启航 通过前面几篇，相信就算是新手也对R语言的历史，R运行环境有了大概的了解。下面就R语言特殊的赋值符号与基本数据元素——向量做简要概述。 1、赋值符号 相信大家学过的编程语言中，赋值 ...

【R语言】单一样本推断问题

2017-05-31

【R语言】单一样本推断问题 非参数统计概念： 在实际问题中，对数据的分布形式和统计模型难以作出比较明确的假定，最多只能对总体的分布做出类似于连续性型分布或者对某点对称等一般性假定。这种不假设总体 ...

R语言-组间差异的非参数检验

2017-05-31

R语言-组间差异的非参数检验 7.5 组间差异的非参数检验 如果数据无法满足t检验或ANOVA的参数假设，可以转而使用非参数方法。举例来说，若结果变量在本质上就严重偏倚或呈现有序关系，那么你可能会希望使用本节 ...

R语言-回归之简单线性回归

2017-05-31

R语言-回归之简单线性回归 8.1 回归的多面性 回归是一个令人困惑的词，因为它有许多特殊变种（见表8-1）。对于回归模型的拟合， R提供的强大而丰富的功能和选项也同样令人困惑。例如， 2005年Vito Ricc ...

R语言-有交互项的多元线性回归

2017-05-31

R语言-有交互项的多元线性回归 许多很有趣的研究都会涉及交互项的预测变量。以mtcars数据框中的汽车数据为例，若你对汽车重量和马力感兴趣，可以把它们作为预测变量，并包含交互项来拟合回归模型，参见代码清单 ...

R语言里面的因子

2017-05-30

R语言里面的因子 R语言中的因子确实不好理解，很多人都这么觉得。在R语言中，因子（factor）表示的是一个符号、一个编号或者一个等级，即，一个点。例如，人的个数可以是1，2，3，4......那么因子就包括，1，2 ...

R语言自定义函数

2017-05-30

R语言自定义函数 R语言某种程度来说本身就是一个函数库，因为它有大量的函数可供调用，加上函数式编程，使得R语言的功能很强大。但是，有时候，根据实际需要，我们还是需要自己动手编写函数，从而减少代码的缀 ...