数据预处理--数据降维
数据规约产生更小但保持数据完整性的新数据集。在规约后的数据集上进行数据分析和挖掘将更有效率。
机器学习领域中所谓的降维就是指采用某种映射方法,将原高维空间中的数据点映射到低维度的空间中。降维的本质是学习一个映射函数 f : x->y,其中x是原始数据点的表达,目前最多使用向量表达形式。 y是数据点映射后的低维向量表达,通常y的维度小于x的维度(当然提高维度也是可以的)。f可能是显式的或隐式的、线性的或非线性的。
目前大部分降维算法处理向量表达的数据,也有一些降维算法处理高阶张量表达的数据。之所以使用降维后的数据表示是因为在原始的高维空间中,包含有冗余信息以及噪音信息,在实际应用例如图像识别中造成了误差,降低了准确率;而通过降维,我们希望减少冗余信息所造成的误差,提高识别(或其他应用)的精度。又或者希望通过降维算法来寻找数据内部的本质结构特征。
在很多算法中,降维算法成为了数据预处理的一部分,如PCA。事实上,有一些算法如果没有降维预处理,其实是很难得到很好的效果的。1
主要是介绍了PCA,还有其他降维算法:LDA(Linear Discriminant Analysis)2,LLE (Locally Linear Embedding) 局部线性嵌入3,拉普拉斯特征映射4。
主成分分析–PCA
主成分分析也称为卡尔胡宁-勒夫变换(Karhunen-Loeve Transform),是一种用于探索高维数据结构的技术。PCA通常用于高维数据集的探索与可视化。还可以用于数据压缩,数据预处理等。PCA可以把可能具有相关性的高维变量合成线性无关的低维变量,称为主成分( principal components)。新的低维数据集会经可能的保留原始数据的变量。
PCA将数据投射到一个低维子空间实现降维。例如,二维数据集降维就是把点投射成一条线,数据集的每个样本都可以用一个值表示,不需要两个值。三维数据集可以降成二维,就是把变量映射成一个平面。一般情况下,n 维数据集可以通过映射降成k 维子空间。5
在Python中,主成分的函数位于Scikit-Learn下:
sklearn.decomposition.PCA(n_components=None, copy=True, whiten=False)
参数说明:
n_components
意义:PCA算法中所要保留的主成分个数n,也即保留下来的特征个数。也可以是设置解释变量的比例。6如:pca =PCA(n_components=.98)
类型:int或者string,缺省时默认为None,所有成分保留。赋值为int,比如n_components=1,将把原始数据降到一个维度。赋值为string,比如n_components=’mle’,将自动选取特征个数n,使得满足所要求的方差百分比。
copy
类型:bool,True或者False,缺省时默认为True
意义:表示是否在运行算法时,将原始数据复制一份。如果为True,则运行PCA算法后,原始数据的值不会有任何改变。因为是在原始数据的副本上进行运算的。
whiten
类型:bool,缺省时默认为False
意义:白化,是的每个特征具有相同的方差。
栗子
from sklearn.decomposition import PCA
import numpy as np
import pandas as pd
data=np.random.randn(10,4)
pca=PCA()
pca.fit(data)
pca.components_ #返回模型的各个特征向量
pca.explained_variance_ratio_ #返回各个成分各自的方差百分比(贡献率)
通过计算累计贡献率,可以确定找到一个合适的n值,比如累计达到97%时,是前3的值,那么下一步去降维时,确定n_components=3。那么,这3维数据占了原始数据95%以上的信息。7
下面,再重新建立PCA模型。
pca=PCA(3)
pca.fit(data)
low_d=pca.transform(data) #用这个方法来降低维度
pd.DataFrame(low_d).to_excel('result.xlsx') #保存结果
pca.inverse_transform(low_d) #必要时,可以用这个函数来复原数据。
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